Centrum Europejskie powstało w 1991 roku jako jedna z pierwszych w Polsce placówek akademickich prowadzących interdyscyplinarne badania dotyczące różnych aspektów integracji europejskiej oraz europeistyki. Jednostkę tworzą zespoły dydaktyczno-badawcze, które zajmują się europejską integracją polityczno-obronną, prawem UE, gospodarką unijną, europejskimi procesami społeczno-kulturowymi oraz informacją europejską. Prace badaczy z CE prowadzone są m.in. w ramach międzynarodowych przedsięwzięć. Do największych z nich należy projekt unijny poświęcony badaniom postaw wyborczych migrantów w Wielkiej Brytanii. Centrum prowadzi również działalność dydaktyczną − na kierunku europeistyka − studia europejskie kształcą się studenci studiów licencjackich oraz magisterskich.
- Centrum Archeologii Śródziemnomorskiej im. Kazimierza Michałowskiego
- Centrum Badań nad Kulturą Warszawy
- Centrum Kształcenia Nauczycieli Języków Obcych i Edukacji Europejskiej
- Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych
- Centrum Nauk Sądowych
- Centrum Nowych Technologii
- Centrum Kompetencji Cyfrowych
- Digital Economy Lab
- Instytut Ameryk i Europy
- Instytut Studiów Społecznych im. Profesora Roberta Zajonca
- Interdyscyplinarne Centrum Modelowania Matematycznego i Komputerowego
- Katedra Erazma z Rotterdamu
- Katedra im. Tadeusza Mazowieckiego
- Katedry UNESCO
- Kolegium MISH
- Kolegium MISMaP
- Ośrodek Analiz Politologicznych
- Ośrodek Badań nad Antykiem Europy Południowo-Wschodniej
- Ośrodek Badań nad Migracjami
- Ośrodek Kultury Francuskiej i Studiów Frankofońskich
- Studium Wychowania Fizycznego i Sportu
- Środowiskowe Laboratorium Ciężkich Jonów
- Centrum Nauczania Języków Obcych
- Uniwersyteckie Centrum Badań nad Środowiskiem Przyrodniczym i Zrównoważonym Rozwojem
- Centrum Transferu Technologii i Wiedzy
- Uniwersytet Otwarty