Szkoła Doktorska Nauk Humanistycznych obejmuje 7 dyscyplin:
- archeologię,
- filozofię,
- etnologię i antropologię kulturową,
- historię,
- językoznawstwo,
- literaturoznawstwo,
- nauki o kulturze i religii,
- nauki o sztuce.
- Międzydziedzinowa Szkoła Doktorska
- Szkoła Doktorska Nauk Ścisłych i Przyrodniczych
- Szkoła Doktorska Nauk Społecznych
- Wydział Archeologii
- Wydział Filozofii
- Wydział Historii
- Wydział Medyczny
- Wydział Nauk o Kulturze i Sztuce
- Wydział Socjologii
- Inne jednostki
- Jednostki naukowe i dydaktyczne
- Wydział „Artes Liberales”
- Wydział Biologii
- Wydział Chemii
- Wydział Dziennikarstwa, Informacji i Bibliologii
- Wydział Fizyki
- Wydział Geografii i Studiów Regionalnych
- Wydział Geologii
- Wydział Lingwistyki Stosowanej
- Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki
- Wydział Nauk Ekonomicznych
- Wydział Nauk Politycznych i Studiów Międzynarodowych
- Wydział Neofilologii
- Wydział Orientalistyczny
- Wydział Pedagogiczny
- Wydział Polonistyki
- Wydział Prawa i Administracji
- Wydział Psychologii
- Wydział Stosowanych Nauk Społecznych i Resocjalizacji
- Wydział Zarządzania