Obecnie znajduje się na kampusie Ochota, gdzie z terenu przy Krakowskim Przedmieściu przeniósł się na początku 2000 roku. Skupia sześć instytutów, ponad 20 zakładów i pracowni. Należą do niego cztery stacje terenowe. Stacja Geobotaniczna znajduje się na obrzeżach Puszczy Białowieskiej, ostatnim na Niżu Europejskim tak dobrze zachowanym fragmencie lasu, w który nie ingeruje człowiek. Warunki do nauki biologii, ekologii, systematyki i oznaczania np. roślin wodnych stwarza Stacja Terenowa w Sajzach, w Urwitałcie prowadzone są zajęcia m. in. z ekologii terenowej, biocenologii czy parazytologii środowiskowej, a hydrobiolodzy swoje badania prowadzą w miejscowości Pilchy, 200 km na północ od Warszawy. Namiastkę dzikiej przyrody w centrum miasta każdy może doświadczyć w Ogrodzie Botanicznym UW, w którym rośnie ok. 5 tys. gatunków i odmian roślin, również tych egzotycznych.
Stacje terenowe:
- Białowieska Stacja Geobotaniczna
- Stacja Terenowa w Sajzach
- Stacja Hydrobiologiczna w Pilchach
- Stacja Terenowa w Urwitałcie